Le pays doit respecter l'intégrité des périmètres des communes mais aussi ceux des communautés de communes, c'est-à-dire qu'un pays ne peut pas "couper" une commune ou une communauté de communes.

Les missions confiées par les communes au pays sont différentes de celles qu'elles transfèrent aux communautés de communes ou d'agglomérations. Si le pays est là pour assurer une stratégie sur un projet commun à l'ensemble du territoire, les intercommunalités ont davantage une fonction de gestion.

Pays et intercommunalités sont donc complémentaires.

De plus, l'existence d'intercommunalité est indispensable pour pouvoir contractualiser avec l'Etat, via le contrat de pays. En effet, pour bénéficier des aides de l'Etat, le territoire doit s'organiser en communautés de communes ou d’agglomérations, en syndicats mixtes ou en groupement d'intérêt public (G.I.P.) de développement local.